今天，纱织得到消息说今天琴酒在游乐场出任务，想去看看的，但是也引导发生了以后的一系列事情
这一天，高中生侦探工藤新一与毛利兰在游乐园游玩时发现琴酒和伏特加执行任务，便跟踪他们，不料被灌下一种叫“APTX4869”的神秘毒药
这边刚灌下毒药，纱织出来了，“呀，好巧啊”
纱织笑眯眯的看着琴酒
“你是什么人”，伏特加警惕的问道
“不得无礼”，琴酒大声训斥道
伏特加惊呆了，从没见过琴酒发如此大的脾气
“没事，我是来找你的，那个毒药就是我爸爸的研究所最近研究出来的吗？给我几颗，我看看”
“这是机密，怎么能给你呢”，伏特加很不是时候的说
“凭我能掌管你的生死，纱织冰冷的说，她是真的生气了
\”小姐，请您大人有大量，原谅他吧”，琴酒看纱织是真的生气了，连忙道歉，毕竟纱织轻而易举就能杀死伏特加，怎么说伏特加也是跟着他的
伏特加，这才反应过来他惹到了不得了的人了
“大小姐，我错了，我再也不敢了”，伏特加连忙道歉，吓得跪着一直磕头
纱织看琴酒都这么说了，也不再对伏特加施压了，周围也不再那么冷了
“那我现在能要这个药了吗？”
“当然，大小姐请”，琴酒看大小姐这是饶了伏特加了，也放下了心
纱织反复端详着这个药
“大小姐，此地不宜久留，我们先离开这吧”，琴酒缓和着气氛说
纱织看了看趴在地上的高中生侦探工藤新一，说，“你们先回组织吧，我再逛逛”
“是，大小姐，我们告退”，刚说完，琴酒和伏特加就消失了
其实刚才她就看到了所谓的高中生侦探工藤新一与他的女朋友毛利兰，纱织不走其实是还想看看工藤新一吃完药之后的反应，而让纱织没想到的是，眼前这个人在逐渐变小，最后停在了小学生的身材，才停下来，纱织在暗处看到这些戏谑的笑了一声便走了。
过了一会警察便来了
为不使周围的人受到牵连，他化名为“江户川柯南”，寄住在毛利兰家中，用阿笠博士发明的手表型麻醉枪，蝴蝶结变声器，解决了许多案件，并一直寻找着黑衣组织的人的下落，希望有朝一日将其绳之以法，并变回原来的样子。这都是后话了。
爸爸，发现研究“APTX4869”的宫野一家有点问题，便让纱织看着她们，而宫野家的二女儿有着被组织看中的敏锐思维，在记事之前就被送往美国留学。在小白鼠实验中发现了APTX4869使服用者身体变小的偶发作用，后在调查中意识到工藤新一服用APTX4869后身体变小并化名为江户川柯南，但并未上报组织，而是擅自将工藤新一的记录改成“死亡”。
纱织发现了这些但并没有上报，她知道爸爸想杀死宫野家的大女儿，这时，她突然有个想法，她很喜欢宫野一家，便想制造宫野明美假死。但是她不能告诉任何人，包括宫野志保
在姐姐宫野明美假死后，因反抗组织而被囚禁。为了自杀服下APTX4869后，身体缩小成小学生模样逃离组织。现寄宿于阿笠博士家中，化名为灰原哀，致力于研究APTX4869的解药。
纱织，看着这几日她调查的事情，心中欢快一笑，做了一个决定
一个谁都没想到的决定，她也要变成小学生